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qPCR #
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Experiment

qPCR #

qPCR(quantitative real time polymerase chain reaction) 은 Real-time polymerase chain reaction, real-time PCR (RT-PCR)라고도 불린다. 목표 DNA 분자의 증폭과 양의 측정이 동시에 이루어진다. DNA가 실시간 측정되는데, 어떤 DNA 이중나선에도 끼어들 수 있는 형광염색과 올리고뉴클레오티드로 이루어진 서열-특이적 DNA탐침이 필요하다.

qPCR 의 활용 #

RNA #

  • Gene Expression Profiling Analysis
  • miRNA Expression Profiling Analysis

DNA #

  • SNP Genotyping & allelic discrimination
  • Somatic Mutation Analysis
  • Copy Number Detection/Variation Analysis
  • Chromatin IP Quantification
  • DNA Methylation Detection
  • Pathogen Detection
  • Viral Quantification

qPCR 워크플로우 #

Denaturation -> Annealing -> Extension -> Denaturation -> Annealing/Extension

qPCR 결과 분석 #

  • ∆Ct = Ct (Target A ‐treated) – Ct (Ref B‐treated)
  • ∆Ct = Ct (Target A‐control) – Ct (Ref B‐control)
  • ∆∆ Ct = ∆ Ct (treated) – Ct (control)
  • Normalized target gene expression level = 2(‐∆∆Ct)

참고문헌 #

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