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UniProt 데이터베이스의 구성 #
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Structured data

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Database

Uniprot 데이터베이스의 구성 #

Uniprot의 주요 데이터베이스는 UniParc database, UniProt database, UniRef database로 구성되어 있다.

UniProt Database #

UniProt Knowledgebase는 UnitProt database 중에서 가장 폭넓은 정보를 제공하며 중심 역할을 하는 핵심 데이터베이스이다. 이 데이터베이스는 정확하고 일관적이며 풍부한 서열 및 기능에 대한 주석을 포함하고 있다. 단백질 서열, 유전자 이름, 서열에 대한 설명, 계통 분류 및 인용 정보 등 기본적인 정보 뿐만 아니라 생물학적 존재, 생물학적 분류, 상호 참조와 실험 데이터, 컴퓨터 데이터를 바탕으로 한 명확한 주석 정보 등을 제공하고 있다.

UniParc Database #

UniProt Archive(UniParc)는 공개된 단백질 서열 데이터 중에서 중복된 서열을 제거한 안정적이고 포괄적인 서열들로 구성된 데이터베이스이다. 공개된 단백질 서열 데이터베이스(Swiss-prot,TrEMBL,PIR-PDB,EMBL,IPI,PDB,RefSeq)에서 중복된 서열을 제거한 후 고유한 단백질 서열만으로 구축된 데이터베이스이다.

UniRef Database #

UniProt Non-redundant Reference(UniRef)는 서열 공간의 전체 범위를 얻기 위해 UniProt Knowledge를 기반으로 구성된 데이터베이스이다. UniProt Knowledge로부터 컴퓨터 분석에 의하여 클러스터된 서열들의 집합인 NREF100, NREF90, NREF50을 말한다. 이 데이터베이스는 중복된 서열을 처리하면서 서열 공간의 허용 범위를 제공하며, 중복을 제거할 수록 UniProt Knowledgebase 정보의 통합이 용이하고, 유사성 검색을 보다 신속하게 수행할 수 있다.

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