Skip to content

UniProt #
Find similar titles

Structured data

Category
Database

UniProt #

UniProt #

UniProt은 Swiss-Prot, TrEMBL 및 PIR-PSD 데이터베이스를 결합하여 생성된 단백질 데이터의 중앙 저장소인 Universal Protein Resource.

Research center #

EMBL-EBI(The European Bioinformatics Institute), UK;
SIB(Swiss Institute of Bioinformatics), Switzerland;
PIR(Protein Information Resource), US.

Data format #

Custom flat file, FASTA, GFF, RDF, XML.

Website #

www.uniprot.org
www.uniprot.org/news/

UniProtKB(UniProt Knowledgebase) #

UniProtKB는 단백질에 관한 기능 정보를 수집하기위한 central hub이며, 정확하고 일관성있는 풍부한 annotation이 붙어 있다. 각 UniProtKB 항목에 필수 핵심 데이터(주로 the amino acid sequence, protein name or description, taxonomic data and citation information)를 캡처할뿐만 아니라 가능한 많은 annotation 정보가 추가된다.

UniProtKB/Swiss-Prot #

High quality annoation과 관련되어 신뢰할 수 있는 단백질 서열 (description of the function of a protein, its domain structure, post-translational modifications, variants 등) 및 최소 수준의 중복성과 다른 데이터베이스와의 높은 수준의 통합을 목표로 하는 데이터베이스로 리뷰가 완료된 데이터로 구성되어 있기 때문에 신뢰도가 높은 정보를 제공하고 있다 (manually annotated, non-redundant). - UniProtKB/Swiss-Prot annotation에는 다양한 sequence 분석 도구가 사용되며, 컴퓨터 예측을 manually하게 평가한다. 이러한 예측에는 post-translational modifications, transmembrane domains and topology, signal peptides, domain identification, protein family classification 등이 포함된다.

  • 2020-08-12 ver. 563,082 sequence entries

Number of entries in UniProtKB/Swiss-Prot over time #

Image

Swiss-Prot entries per taxonomic group & Eukaryota #

Image

Amino acid distribution statistics #

Image


UniProtKB/TrEMBL #

Swiss-Prot 데이터베이스에 등록되기 위해 소요되는 시간보다 새로운 sequence 데이터가 생성되는 속도가 현저히 빠르기 때문에, 이러한 새로운 sequence 데이터는 TrEMBL 데이터베이스에 등록이 되어 제공된다. 그로 인해 TrEMBL 데이터베이스에는 리뷰되지 않은 데이터가 쌓이게되어 Swiss-Prot 데이터보다는 신뢰도가 떨어지지만, 데이터 양 측면으로 보면 Swiss-Prot 데이터베이스보다 방대한 양의 데이터를 보유하고 있다.

  • 2020-08-12 ver. 188,961,949 sequence entries

Number of entries in UniProtKB/TrEMBL over time #

Image

TrEMBL entries per taxonomic group & Eukaryota #

Image

Amino acid distribution statistics #

Image

Reference #

Incoming Links #

Related Articles #

Related Bioinformaticses #

Suggested Pages #

0.0.1_20140628_0