Transcription factor prediction database
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DBD는 완전히 해독된 지놈의 예측된 transcription factor(TF) 데이터베이스이다. 예측된 TF는 DNA-binding domain families정보를 담고 있으며 Markov model의 Superfamily와 Pfam 라이브러리를 기반으로 구축되었다. 각 생물종, 지놈, families별로 예측된 TF정보를 확인할 수 있으며, 다운로드를 통해 활용할 수 있다. 현재 930개의 완전 해독된 지놈에 대한 정보들을 담고 있다.
- 지놈와이드 TF repertoir prediction link: [[http://www.transcriptionfactor.org/index.cgi?Browse]]
- 수동으로 curated된 DNA binding domain families link: [[http://www.transcriptionfactor.org/index.cgi?Domain+domain:all]]
- sequence ID, domain family or submit a protein sequence: [[http://www.transcriptionfactor.org/index.cgi?Search]]
