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ThermoFisher NGS 장비 상세 (책 발간용 글 편집 및 수정) #
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Category
Analysis

ThermoFisher #

최초의 시퀀싱 장비를 내놓은 Applied Biosystems(ABI)사가 있었지만 Invitrogen과 합병되고 이후 Life Technologies사로 합병되었다.

ThermoFisher NGS 장비 #

SOLiD 장비는 2세대 Sequencer 장비로 emulsion PCR 방식을 활용하였다. SOLiD 장비의 후속 장비로 5500 시리즈가 출시되었으며 정확도를 점차 향상시켰다.
Thermo Fisher Scientific에서는 2010년에 SOLiD 5500 w, Ion Torrent, IonPGM으로 출시를 시작했다. 2012년 부터 Ion Proton을 출시하면서 Proton series 들이 출시되고 있다. Proton PIII는 기존 series보다 lead length가 2배로 400bp이다. Proton PI, PII 는 각각 165 million wells/2 human exomes, 660 million wells/1 human genome 의 성능을 가진다. 또 Thermo Fisher에서 Ion AmpliSeq 제품을 가지고 있다. 10kb 영역을 표적화한 전형적인 분석의 경우 2시간 정도 만에 완료된다. 또한, 최근 반도체 기반 NGS 시스템 Ion GeneStudio S5를 출시했다. 반도체 시퀀싱 기술을 기반으로 한 ‭Ion GeneStudio S5 prime과 Ion GeneStudio S5 plus라는 NGS 장비이다. Ion GeneStudio S5 prime의 최대출력은 50Gb, Ion GeneStudio plus의 최대 처리량은 30Gb이다.

Image << 출처 : 차세대염기서열분석법(NGS)의 응용 (1), 영인프런티어 >>

ThermoFisher 장비 비교 #

Ion Torrent #

Image << 출처 : http://blog.naver.com/hyouncho2/60208208028 >>

Ion GeneStudio S5 #

Image << 출처 : ThermoFisher Scientific 홈페이지 >>

Reference #

0.0.1_20140628_0