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Sequel #

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  • 최초 작성자
    JSeo
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Structured data

Category
Experiment

Sequel #

Pacific biosystem(Pacbio) 사에서 2015년 처음 선보인 large scale 시퀀싱 장비이다.
Sequel system은 SMRT(Single molecule real time)의 장점을 그대로 유지하면서 기존의 PacBio® RSII 보다 처리량과 확장성은 커졌지만, 부피와 비용은 절감된 획기적인 시퀀싱 시스템이다.
더 자세히 이야기하자면 Sequel은 PacBio RSII와 비교했을 경우 SMRT cell 당 약 7배 더 많은 read를 생산할 수 있다. 많은 read를 생산할 수 있으므로 시간과 비용이 절감되는 효과를 볼 수 있다. 거기에 크기와 무게는 RSII의 1/3 수준으로 물리적으로도 유리하다.

Image

[출처 : http://core-genomics.blogspot.kr]

Full-length Transcriptome 분석 #

전장전사체 시퀀스를 isoform 추론 알고리즘을 사용하는 Iso-seq을 사용하여 sequel로 시퀀싱을 하여 transcriptome의 5'에서 polyA tail까지 전체 cDNA서열을 생성한다.

Video : The Sequel System #

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