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QIIME #
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QIIME (Quantitative Insights Into Microbial Ecology) #

  1. 미생물의 DNA시퀀스 데이터를 분석하는 open source 프로그램 이다.
  2. QIIME은 Quantitative Insights Into Microbial Ecology의 줄임말로 chime이라고 발음 된다.
  3. Demultiplexing으로 시퀀스들을 tag나 barcode로 분리하고 OTU 분석 가능하다.
  4. Metagenome 분석을 위해 taxonomy입히기, phylogenetic tree 그리고 diversity 분석해서 시각화 하는 작업이 가능하다.
  5. QIIME은 phtyhon2로 작성된 스크립트들과 외부의 다른 어플리케이션으로 구성되어 있고 분석자의 의도에 따라 유연성있게 수정이 가능하여 자신의 분석 파이프라인 구성이 가능하다.
  6. CUI방식의 분석툴로 사용자가 분석을 할때 커맨드를 입력을 해 주어야 한다.

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