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Pfam #
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Structured data

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Database

Protein Domain #

단백질 서열의 한 부분으로, 독립적으로 진화하고 기능을 가지고 있다.

Protein은 하나 이상의 domain으로 이루어져 있으며, 그 기능은 각 domain이 가진 기능으로 나타난다.

두 개의 서열에서 동일한 domain을 가지고 있다고 하여 같은 기능을 하는 것은 아니지만 비슷한 기능을 하고 있다고 유추해 볼 수는 있다.

Pfam database #

Hidden Markov models을 이용하여 일반화된 multiple sequence alignment 및 annotation 정보들을 가지고 있는 protein family들을 모아놓은 데이터베이스이다.

2013년 3월 기준, 14,831개의 families 정보로 구성되어 있다.

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