PGMD : The PharmacoGenomic Mutation Database #

PGMD는 publish된 유전학적인 변이들 중에 약물반응에 영향을 미치는 변이들의 정보를 제공하는 BIOBASE사의 데이터베이스이다.

이 데이터베이스는 매일 임상 시험을 진행한 논문들로부터 genotype과 약물반응의 유의적인 상관관계를 제공하고 있다.

Benefits #

• 약물 반응 변이에 대한 자세한 리포트를 제공함 : treatment administered, observed phenotype, statistical significance, and study population attributes including age, sex, ethnicity 등

• 임상 실험을 위한 단계별 환자의 유전학적인 마커의 적은 리스트

• 환자의 약물 반응을 예측하여 질병 치료의 우선순위를 조절할 수 있음

(출처 : BIOBASE PGMD Overview datasheet PDF)

Key Features #

• 139,000개 이상의 drug response phenotype들과 연관된 genotype, haplotype 정보

• 7,000개 이상의 pharmacogenomic 변이를 포함한 유전자 리포트 정보

• 1,300개 이상의 drug 리포트 정보

• 525개 이상의 질병 리포트 정보

(출처 : BIOBASE PGMD Statistics 2016.1 Release)

Access Options #

• Online 버전 : Pharmacogenomic Mutation DB를 온라인 웹 인터페이스를 통하여 사용 가능
• Download 버전 : PGMD 내에 존재하는 데이터들을 TSV 파일로 제공 받음
• Relational Database Downlaod : 로컬 PC에 완전한 PGMD 관련 DB를 설치하여 사용

이러한 PGMD는 academic 연구자라면 제한된 기능으로 무료 access 할 수 있다.

• 신청 방법 : https://portal.biobase-international.com/cgi-bin/portal/trial_pgmd.cgi

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