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Oncomine Power Tools #
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Software

Oncomine™ Power Tools #

Image [그림1] Cancer cell lines의 유전자 Copy number

  • 샘플수준 드릴다운 기능을 통해 단일 스냅샷 뷰에서 모든 암 유형의 중요 변이를 식별가능
  • 여러 임상 데이터세트에서 초점 증폭(focal amplication)을 식별하고 핵심(driver) 증폭/결손과 일과성(passenger) 증폭/결손을 구분.
  • 여러 독립적인 데이터세트에서 여러 암 유형의 차별적 발현을 식별 및 확인.
  • 특이적 유전자의 돌연변이 빈도를 조사하거나 암 유형에서 가장 많이 발생하는 돌연변이를 식별
  • 2014년 보고에 따르면 8,000개 넘는 샘플 (42개의 cancer types 포함)

Database Contents #

  • COSMIC cell lines Project
  • Broad GDAC Mutation Packager의 TCGA 데이터
  • DCC level2의 TCGA데이터
  • TCGA 데이터를 Oncomine mutation call함
  • NGS mutation에 대한 문헌정보들

Oncomine™ Power Tool과 Oncomine™ NGS Power Tool 비교 #

Image [그림2] Oncomine™ Power Tool과 Oncomine™ NGS Power Tool 비교

Image [그림3] KRAS mutation

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