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Nextbio #
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Structured data

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Business

Nextbio는 생명과학 및 의학 연구자들에게 공공 데이타 내의 지식들을 검색, 공유, 발견할 수 있는 innovative platform을 제공하는 회사이다. 2004년도에 설립되었으며, 50여명의 직원들로 구성되어져 있으며 본사는 Santa Clara, California에 위치하고 있다.

주요 사업 및 핵심 기술 #

  • Nextbio platform은 많은 데이터와 문서정보들을 연결시키는 Ontology 기반의 semantic framework이다. Semantic framwork은 유전자, 조직, 화합물, ontology들로 구성되어져 있으며, framework 다른 종들, 플랫폼, 데이터 유형 그리고 연구들로 부터 얻은 정보들을 포함한다. Nextbio 자체적으로 큐레이션한 데이터양은 15,113건이며, 타 경쟁 회사로는 대표적으로 Oncomine이 있다.
Search platform 서비스 내용 비고
Body Atlas 조직, cell line, cell type, stem cell 내에 query gene의 curated expression level 정보 제공
Disease Atlas query gene 관련 질병 순위 정보를 mutation, miRNA expression level, somatic mutation, copy number등의 정보들과 함께 제공
Pharmaco Atlas query gene의 expression level 변화시킬 수 있는 parmaco 및 물질을 카테고리화 하여 순위정보 제공
Knockdown Atlas query gene의 expression level 변화시킬 수 있는 다른 유전자 정보 제공
Genetic Markers 하나의 phenotype 혹은 compound들에 중요하게 관련있는 유전자와 mutation정보들을 찾아주는 서비스
Pathway Enrichment query term과 관련된 pathway bioset들의 정보를 제공
Clinical Trials query term과 match되는 clinicaltrial 모든 정보를 보여 주는 서비스
Literature query term과 match되는 Pubmed publication 리스트를 보여 주는 서비스
Visual Application query term이 관련되어진 chromosome상의 위치 및 SNP 등등의 정보를 시각화하여 보여주는 서비스

경쟁 platform간 비교 #

항목 NextBio Oncomine
이용범위 Bio 전체연구 Cancer 연구
주요고객 Bio 관련 모든 연구자 Cancer 연구자, 제약회사
Data양 15,113건 729건
0.0.1_20140628_0