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NextSeq #
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Experiment

NextSeq 500? #

Illunimia 사에서 2014년 새로이 출시한 150Gb의 throughput을 가지는 desktop 버전의 대용량 시퀀싱 플랫폼이다.(그림 1.)

Exome, Whole genome, Transcriptome 시퀀싱을 빨리 할 수 있고, 필요하다면 낮은 Throughput 시퀀싱으로 바꿀수 있는 유연함을 가지고 있다.

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그림 1. NextSeq 500

Specifications #

NextSeq 500은 high/midium output 모드를 제공한다.

  1. High output mode : 10개의 mRNA샘플의 시퀀싱을 18시간만에 2x75염기를 4천만개의 paired end를 생산한다.
  2. Medium output mode : 3개의 mRNA 샘플을 위와 같은 길이로 15시간만에 생산한다.

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표 1. NextSeq 500의 처리속도와 생산량

Features #

  1. Whole genome, Exome, Transcriptome 등의 시퀀싱을 수행하는 최초의 데스크탑 시퀀서
  2. 다양한 시퀀싱 어플리케이션을 지원하고 리드길이의 조정 등 연구목적에 맞게 output의 설정을 다양하게 바꿀 수 있는 유연성
  3. 빠른 러닝시간
  4. Homopolymer문제없이 고품질의 결과를 가져오는 매우 정확한 SBS chemistry
  5. 간편한 작동과 쉬운 분석
  6. Illumina 소속 과학자와 기술자들이 설치, 교육, 어플리케이션과 데이터분석 지원

비디오 1. NextSeq500 : The next evolution in sequencing

Comepare with MiSeq and HiSeq in a single run #

데스크탑 장비로서는 MiSeq과 같지만 MiSeq에서 할 수 없는 whole genome sequencing이 가능하고, 샘플에 따라 throughput의 양을 설정할 수 있다. HiSeqMiSeq의 장점이 적절히 섞인 대용량 genome 시퀀싱이 가능한 작은 시퀀서이다.

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표 2. Illumina 장비들의 처리량 비교


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그림 2. Illumina의 시퀀싱 장비들


출처 : http://www.illumina.com/systems/nextseq-sequencer.ilmn

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