NextSeq #

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최초 작성자
biomed1016@gmail.com 2014-06-27 04:37:30
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SeokmoonChoi 2015-05-18 01:11:08

Structured data

Category: Experiment

NextSeq 500?
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NextSeq 500? #

Illunimia 사에서 2014년 새로이 출시한 150Gb의 throughput을 가지는 desktop 버전의 대용량 시퀀싱 플랫폼이다.(그림 1.)

Exome, Whole genome, Transcriptome 시퀀싱을 빨리 할 수 있고, 필요하다면 낮은 Throughput 시퀀싱으로 바꿀수 있는 유연함을 가지고 있다.

그림 1. NextSeq 500

Specifications #

NextSeq 500은 high/midium output 모드를 제공한다.

High output mode : 10개의 mRNA샘플의 시퀀싱을 18시간만에 2x75염기를 4천만개의 paired end를 생산한다.
Medium output mode : 3개의 mRNA 샘플을 위와 같은 길이로 15시간만에 생산한다.

표 1. NextSeq 500의 처리속도와 생산량

Features #

Whole genome, Exome, Transcriptome 등의 시퀀싱을 수행하는 최초의 데스크탑 시퀀서
다양한 시퀀싱 어플리케이션을 지원하고 리드길이의 조정 등 연구목적에 맞게 output의 설정을 다양하게 바꿀 수 있는 유연성
빠른 러닝시간
Homopolymer문제없이 고품질의 결과를 가져오는 매우 정확한 SBS chemistry
간편한 작동과 쉬운 분석
Illumina 소속 과학자와 기술자들이 설치, 교육, 어플리케이션과 데이터분석 지원

비디오 1. NextSeq500 : The next evolution in sequencing

Comepare with MiSeq and HiSeq in a single run #

데스크탑 장비로서는 MiSeq과 같지만 MiSeq에서 할 수 없는 whole genome sequencing이 가능하고, 샘플에 따라 throughput의 양을 설정할 수 있다. HiSeq과 MiSeq의 장점이 적절히 섞인 대용량 genome 시퀀싱이 가능한 작은 시퀀서이다.