NetAge
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NetAge 데이터베이스는 2009년 6월에 구축된 노화 데이터베이스로 노화와 관련된 Protein-Protein Interaction (PPI) 정보 및 microRNA 정보를 네트워크 형태로 제공하고 있다. NetAge 데이터베이스 컨텐츠의 핵심아이디어는2007년 게재된 논문에서 잘 드러난다.
"Many LAGs and longevity-associated pathways are evolutionary conserved, from yeast to human"
- Arie Budovsky et al. Longevity network: Construction and implications. 2007, MECHANISM OF AGEING AND DEVELOPMENT.
종 분화에 의해 공통 조상으로부터 진화하여 같은 기능을 가진 다른 종들의 유전자들을 데이터베이스화 하여 구축되었다. DB내에서 다루고 있는 종들은 총 4가지 (H.Sapiens, S.cerevisiae, C.elegans, D.melanogaster)이다.
구축된 DB 현황은 아래와 같다.
| 구분 | 데이터 수 |
|---|---|
| Total number of species/interactomes | 4 |
| Number of nodes (in all interactomes) | 23,641 |
| Number of genes (in all interactomes) | 23,515 |
| Number of microRNAs (in all interactomes) | 126 |
| Number of interactions (in all interactomes) | 134,941 |
| Number of PPIs (in all interactomes) | 134,224 |
| Number of miRNA interactions (in all interactomes) | 717 |
| Number of gene sets/networks (constructed in all interactomes) | 42 |
| Number of nodes included in at least one gene set (in all interactomes) | 8,929 |
| Number of annotations (in all interactomes) | 87,285 |
참고 자료 #
- Arie Budovsky et al. Longevity network: Construction and implications. 128(2007):117-124
- http://netage-project.org/
