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NetAge #
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NetAge 데이터베이스는 2009년 6월에 구축된 노화 데이터베이스노화와 관련된 Protein-Protein Interaction (PPI) 정보 및 microRNA 정보를 네트워크 형태로 제공하고 있다. NetAge 데이터베이스 컨텐츠의 핵심아이디어는2007년 게재된 논문에서 잘 드러난다.

"Many LAGs and longevity-associated pathways are evolutionary conserved, from yeast to human"

- Arie Budovsky et al. Longevity network: Construction and implications. 2007, MECHANISM OF AGEING AND DEVELOPMENT.

종 분화에 의해 공통 조상으로부터 진화하여 같은 기능을 가진 다른 종들의 유전자들을 데이터베이스화 하여 구축되었다. DB내에서 다루고 있는 종들은 총 4가지 (H.Sapiens, S.cerevisiae, C.elegans, D.melanogaster)이다.

구축된 DB 현황은 아래와 같다.

구분 데이터 수
Total number of species/interactomes 4
Number of nodes (in all interactomes) 23,641
Number of genes (in all interactomes) 23,515
Number of microRNAs (in all interactomes) 126
Number of interactions (in all interactomes) 134,941
Number of PPIs (in all interactomes) 134,224
Number of miRNA interactions (in all interactomes) 717
Number of gene sets/networks (constructed in all interactomes) 42
Number of nodes included in at least one gene set (in all interactomes) 8,929
Number of annotations (in all interactomes) 87,285

참고 자료 #

  1. Arie Budovsky et al. Longevity network: Construction and implications. 128(2007):117-124
  2. http://netage-project.org/

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