개요 #

MultiQC는 [NGS] 데이터 각 분석과정에서 생성되는 로그 파일들을 이용하여 단계별 분석 결과에 대한 통합 리포트를 html 형식으로 생성해 주는 프로그램이다. [NGS] 분석에 흔히 사용되는 대부분의 분석 프로그램들의 로그 파일일을 인식할 수 있으며, 개발자 모드를 사용하는 경우 MultiQC에서 지원하지 않는 툴에 대하여 사용자가 직접 모듈을 추가할 수 있다. 통합리포트 는 링크를 참조한다.

설치 방법 #

Requirement #

• Python
  • MultiQC에서 지원하는 버전 대는 다음과 같다.
  • 2.7 +, 3.4+ or 3.5+

pip를 이용한 설치 방법 #

pip install multiqc

conda를 이용한 설치 방법 #

conda install -c bioconda -c conda-forge multiqc

메뉴얼 설치 방법 #

curl -LOk https://github.com/ewels/MultiQC/archive/master.zip
unzip master.zip
cd MultiQC-master
pip install .

사용 방법 #

기본 사용 커맨드 #

multiqc <path/to/analysis> --dirs-depth <number of directory depth to analysis> -outdir <path/to/save> --filename <report file name>

특정 파일에 대한 분석을 원치 않는 경우 #

multiqc <path/to/analysis> --ignore <ignore file pattern or file name> -outdir <path/to/save> --filename <report file name>

지정한 파일에 대한 분석만 원하는 경우 #

multiqc --file-list <file_path.txt> -outdir <path/to/save> --filename <reportfile name>

지원 프로그램 #

• 지원 프로그램

참조 문헌 #

• MultiQC