Mouse phenome database #

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최초 작성자
Kirke 2016-03-20 09:09:46
최근 업데이트
Youngchul Jeon 2016-05-01 11:41:52

Structured data

Category: Database

Mouse Phenome Database(MPD)
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Mouse Phenome Database(MPD) #

개요 #

MPD는 웹 기반의 마우스 표현형 데이터베이스로써 다양한 계통의 실험용 마우스 표현형에 대한 측정치데이터를 포함한다. 계통 고유의 상태뿐만 아니라 약물, 식이, 질병 및 나이와 같은 요인에 의한 영향도 포함한다. 표현형 외에도 유전자발현, SNP, variation과 같은 유전적 정보를 포함하며, 측정에 사용된 방법, 논문 및 관련된 프로젝트에 대한 정보를 함께 제공한다. MPD는 2000년에 시작되었으며 미국 NIH와 Jackson Laboratory의 지원으로 운영되고 있다.

목적 #

실험용 마우스의 각 계통의 표현형 정보를 제공함으로써 연구자가 마우스를 이용한 연구 결과의 해석과 이해를 돕고자한다. 또 실험계획에서 효율적인 계통의 선택에 도움을 주는 것을 목적으로한다.

표현형측정치 #

실험용 마우스 계통의 체중, 장기의 무게 및 성분, 혈액생리, 수명과 같은 기본 표현형 뿐만아니라 행동학적 특성, 운동생리, 암, 약물반응과 같은 심화된 표현형 분류가 되어 있으며, 각 분류는 실험방법에 따라 세분화되어져 있다.

참조 MPD: Phenotype data detailed categories

자료의 이용 #

MPD는 실험용 마우스의 표현형, 유전자형 및 QTL과같은 정보를 웹 상에서 시각화하거나 raw data로써 실험자가 획들할 수 있도록한다. 이를 통해 두 종 이상의 측정치 비교가 가능하다.

참조 #

Maddatu TP, Grubb SC, Bult CJ, Bogue MA. Mouse Phenome Database (MPD). Nucleic Acids Res. 2012 Jan;40(Database issue):D887-94.

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