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MinION #
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MinION? #

Oxford Nanopore Technologies사에서 개발한 NGS시퀀싱 장비이다. GridION system으로 분석한다. MinION은 USB를 전력으로 하여 사용하기 때문에 데스크탑, 노크북에 꽂아서 사용이 가능하며, 손바닥만한 크기로 휴대성이 좋아 어디서든 실시간으로 DNA나 RNA 시퀀싱을 할 수 있다.

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[출처 : MIT technology]

샘플링하는 키트 또한 간편하게 사용할 수 있으며, 필드에서 바로 시퀀싱이 필요한 경우 시료를 가지고 그 자리에서 DNA혹은 RNA을 추출하여 시퀀싱을 할 수 있다. MinION은 최대 수백 Kb까지 read를 뽑을 수 있다.

MinION의 원리 #

MinION은 PCR이 필요했던 기존의 시퀀싱 방법과는 다른 방법으로 시퀀스를 읽는다. 칩으로 시퀀스를 읽는다. 장비의 port에 샘플을 넣으면 내부 membrane에 박혀있는 nanopore를 통과하면서 각 염기마다 다른 전기적 신호를 읽어 시퀀싱을 한다.

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[출처 : MIT technology]

MinION의 장점 #

MinION의 특징이자 장점은 두가지를 제시할 수있다. 첫번째로 장치의 휴대성이다. 기존 데스크탑 장치와는 달리, 스마트폰 정도로 크기가 작다. 두번째로는 pcr이 아닌 전기적 방법의 시퀀싱 때문에, 시퀀싱의 결과가 굉장히 빠르다. 현재까지 가장 빠른 runtime으로 약 15분이다.

MinION의 성능 #

512 nanopore channels
read length : 5Kb-200kb
Run time : <10mins,2pots
kit cost : $1,000

MinION application #

MinION application 은 다음과 같이 이용할 수 있다.

application #

Microbiology
Microbiome
Basic genome research
Human genetics
Cancer reasearch
Clinical research
Plant reasearch
Transcriptome analysis
Population genomics
Animal research

SmidgION 출시 #

MinION제품을 만든 회사 Oxfrod Nanopore에서 새로운 제품을 출시했다.SmidgION은 스마트폰에 바로 연결해서 시퀀싱을 할 수 있는 장치이다. 스마트폰을 사용해 현장에서 신속하게 시퀀싱의 결과를 분석할 수 있다. 기존 시퀀싱 장치에 이동하기까지 시료의 보존이 힘들거나 조건이 어려울 때, 이를 이용하여 개선할 수 있을 것이다.

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[출처 : http://www.medigatenews.com/news/2324027284]

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