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Microbiome #
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Category
Biology

개념 #

마이크로바이옴(microbiome, 미생물군집체)이라고도 부르며, 인간의 몸속에서 함께 공존하고 있는 미생물의 유전정보 전체를 일컫는다. 반면, 게놈(genome)은 인체 자체의 유전정보 모두, 즉 유전자 집합체를 일컫는다. 최근 우리 몸속에 서식하는 미생물이 인체에 미치는 영향력이 매우 크다는 것이 연구결과 밝혀짐으로써 세컨드 게놈에 대한 연구가 진행되고 있다. 인체 내의 각종 미생물은 생체대사 조절 및 소화능력이나 각종 질병에 영향을 미치고, 환경변화에 따른 유전자 변형 및 다음 세대로 전달되는 과정 등 인체의 모든 기능에 영향을 미치는 것으로 알려져 있다. 특히 알레르기나 비염, 아토피, 비만과 관련된 각종 대사ㆍ면역질환, 장염, 심장병 등이 이러한 세컨드 게놈과 관련된 것으로 보고되고 있다.

NGS 를 이용한 연구 #

최근 인간의 microbiome 연구방법으로 gDNA sequencing을 이용한 연구가 활발히 진행되고 있다. Metagenome 분석을 통해 미생물군집의 구조를 밝히고 세부적인 기능을 연구가 가능하다. 일반적으로 300만에서 1억개의 microbiome 유전자들이 장에서 군집하고 있고, 이를 NGS를 통해 모니터링 할 수 있다.

microbiome 을 이용한 personal 서비스 #

European MetaHit project 를 이끈 Dr. Ehrlich의 팀은 개인의 gut microbiome 을 이용해 건강을 체크해주는 서비스를 준비하고 있다. 서비스를 의뢰하면 NGS 분석 파이프라인을 통해 개개인의 gut microbiome 의 종류와 분포가 밝혀지고 어떤 질병에 노출되어 있는지 확인 할 수 있다. 2014년 7월 14일 까지 유럽인 800명의 gut microbiome database 를 구축했으며, 앞으로 5,000명의 샘플확보를 목표로 하고 있다.

reference #

www.google.co.kr
Qin et al. Nature, 464, 59-65, 2010
Special Sessions, ISMB 2014
http://my.microbiome.eu/

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