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Maq #

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10회 업데이트 됨.

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  • 최초 작성자
    Hana Song
  • 최근 업데이트
    dongiljogun

Structured data

Category
Algorithm

개요 #

Maq(Mapping and Assembly with Quality)은 Sanger Center에서 개발한 assembly 알고리즘으로 short reads를 이용한 reference assembly에 주로 사용하며, de novo assembly는 할 수 없다. NGS 1세대 장비의 데이터 분석용으로 설계되었으며, 커맨드라인을 통해 설치 및 분석에 이용할 수 있다.

Workflow #

Image

Maq command #

Reference #

0.0.1_20240214_1_v81