Skip to content

MUMmer #
Find similar titles

Structured data

Category
Software

개요 #

MUMmer는 유전체 비교 분석을 위해 개발된 프로그램으로 비교적 거리가 가까운 미생물의 유전체 서열 비교하는 작업에 최적화되어 있다. MUMmer는 suffix-tree 알고리즘을 기반으로, 많은 염기서열의 align을 쉽고 빠르게 수행할 수 있도록 개발되었다.

성능 #

  • 유전체 비교 분석 소요 시간 예제
비교 종 MUMmer 2.1 MUMmer 3.0
E.coli K12 vs. E.coli O157:H7 102 MB / 18 s 77 MB / 17 s
S.cerevisiae vs. S.pombe 261 MB / 51 s 204 MB / 47 s
A.fumigatus vs. A.nidulans 578 MB / 128 s 459 MB / 120 s

Reference #

Incoming Links #

Related Bioinformaticses #

Suggested Pages #

0.0.1_20140628_0