MOLE-BLAST #

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최초 작성자
ykkang@insilicogen.com 2015-03-25 04:48:10
최근 업데이트
nwchoi@insilicogen.com 2016-06-29 08:22:51

Structured data

Category: Software

MOLE-BLAST란? #

MOLE-BLAST는 BLAST Search를 이용해 염기서열의 유사성 결과를 바탕으로 계통학적 정보를 제공한다. NCBI에서 제공하고 있는 웹기반 분석도구로 서비스하고 있다. MOLE-BLAST는 3단계로 파이프라인이 구성되어 있다. 첫째, BLAST Search를 통해 사용자 쿼리 시퀀스의 염기서열 유사성 결과를 보여준다. 둘째, 유사성이 높은 상위 그룹을 이용해서 다중서열 분석(Multiple alignment Search)을 진행한다. 이때 MSA 분석 툴로는 MUSCLE을 이용한다. 셋째, MUSCLE로 분석된 결과를 Phylogenetic tree 등의 분석 결과를 제시한다.

NCBI MOLE-BLAST 서비스 URL : http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/moleblast/moleblast.cgi

MOLE-BLAST work flow #

#!dot/s
"Blast Search" -> {"Clustering"};
"Clustering" -> {"Multiple Sequence Alignment"; "Multiple Sequence Alignment"; "Multiple Sequence Alignment";};
"Multiple Sequence Alignment" -> {"Phylogenetic tree"; "Phylogenetic tree"; "Phylogenetic tree";}