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MACS2 #
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MACS2? #

MACS version1.4와 차이 #

하드웨어 #

내용 #

Advanced call peaks #

1) 중복된 리드의 제거(Filter duplicates)
2) Fragment 길이 (d)의 결정
3) ChIP 샘플의 길이 확장(Extend fragment)
4) control 샘플로 부터 background bias를 빌딩
5) control과 ChIP샘플의 시퀀싱 depth의 스케일 보정
6) ChIP과 local lamda를 비교하여 pvalue와 qvalue 계산

Call differential binding events #

결과 #

참고문헌 #

  1. http://liulab.dfci.harvard.edu/MACS/
  2. https://github.com/taoliu
0.0.1_20210630_7_v33