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Illumina NGS 장비 상세 #
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Analysis

Illumina NGS 장비 #

Illumina(USA)는 2016년에 NovaSeq 6000 장비를 출시했다. 자사 기기 Hiseq X 와 비교했을 때 5배 향상되었다. 2일만에 6TB, 약 60명의 data를 처리한다. 그리고 최근(2018.01)에 iSeq 100이라는 또다른 장비를 선보였다. 기존 자사 장비들보다 성능은 떨어지지만 작고 편리하며, 가격을 큰 폭으로 낮췄다. 미생물이나 바이러스 같은 작은 생물에 용이하고, 적은 양으로 빠른 결과를 나타낼 수 있다고 설명한다.
또 Ion torrent의 AmpliSeq기술을 Illumina에서 사들여 출시했다.

HiSeq과 NovaSeq의 비교는 아래 이미지를 참고하면 된다.

Image << 출처 : 한국투자증권, 헬스케어 100달러 게놈시대가 열린다면, 2017.1.13. >>

Illumina 장비 비교 #

HiSeq X Ten HiSeq 2500 NextSeq 500 MiSeq iSeq 100
Read Length (bp) 2x150 2x125 n 2x150 2x300 2x150
Run Time 3일 6일 29시간 ~65시간 17.5시간
Total Output 1.8Tb 1 Tb ~100 Gb ~ 5.5Gb 1.2 Gb
Quality Score > 75% > 80% > 75% > 70% > 80%

Image << 출처 : Illumina 홈페이지 >>

Reference #

  • 한국투자증권, 헬스케어 100달러 게놈시대가 열린다면, 2017.1.13.
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