IMGT
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IMGT (ImMunoGeneTics) #
IMGT는 면역에 관한 유전학 및 정보학 분야의 세계적인 레퍼런스 자료로써, 1989년 LIGM, Montpellier, France에 의해 탄생된 가장 크고 오래된 데이터베이스다. IMGT/LIGM-DB는 등록된 데이터베이스에서의 모든 germline, IG (immunoglobulin) 및 T-세포 수용체의 gDNA, cDNA 서열을 포함하고 있다. 웹 인터페이스를 통해 사용자의 관심에 따라 5 가지의 모듈로 생물/면역관련 내용으로 검색이 가능하다. 시퀀스는 전문적으로 annotation되어 품질과 정확성이 향상된 정보로 함께 제공 되어진다. IMGT-ONTOLOGY의 주요 개념에 따라 서열 식별, 유전자 및 대립 유전자 분류, 구성, 특정 motif 정보, 코돈 및 아미노산 번호와 서열 관련 정보 등이 포함된다. IMGT/V-QUEST tool을 통해서는 IMGT flat 파일, 코딩영역의 translation 정보와 분석을 9 가지 형식으로 표현된 결과를 볼 수 있다. IMGT는 EBI (유럽), DDBJ (일본) 및 NCBI (미국)와 긴밀하게 협력하여 운용된다.
검색 #
<그림 1. 기본 검색>
Accession number, IMGT annotation level, Sequence length, Definition 검색
<그림 2. IMGT-ONTOLOGY concepts 검색>
종, 유전자 형식, 구조 등의 Identification 검색IMGT 분류체계의 검색
Description 및 Obtention 검색
<그림 3. bibliographical references 검색>
문헌/저서를 통한 검색결과 #
<그림 4. 검색결과>
Reference #
1) http://www.imgt.org/
2) 2006. NAR. IMGT/LIGM-DB, the IMGT® comprehensive database of immunoglobulin and T cell receptor nucleotide sequences.