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HMDB #

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  • 최초 작성자
    yhha
  • 최근 업데이트
    테라

(http://www.hmdb.ca/)

· HMDB(Human Metabolome Database)는 인체에서 발견되는 소분자 대사물(metabolite)에 대한 자세한 정보를 포함하고 있는 전자 데이터베이스로 무료 이용이 가능하다. (2018년 2월 현재 version 4.0)

· 3가지 타입의 데이터를 포함 또는 링크하고 있다. : 1) chemical data, 2) clinical data, 3) molecular biology/biochemistry data

· 수용성 및 지용성 대사물, >1uM로 풍부하거나 <1nM로 희소한 대사물까지 114,100개의 대사물을 포함하며, 이 대사물에 대한 5,702개의 단백질 서열 정보를 연결하고 있다.

· 5,700개 이상의 화합물로 실험한 MS/MS data, 1,300개 이상의 화합물로 실험한 1H and 13C NMR data (and assignments), 780개 이상의 화합물의 GC/MS spectral and retention index data와 3,100개 화합물의 예측 1H and 13C NMR spectra의 정보를 포함하고 있다.

· DB는 대사체학, 임상 화학, 바이오마커 탐색 및 일반적인 교육에 활용되도록 고안되었다.

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