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GFF #
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Structured data

Category
Analysis

개요 #

GFF(General Feature Format)는 어떤 서열의 각 부분별 주석(features 또는 annotations) 정보만 테이블 형식으로 표현한 포맷이다.

  • Gene, Exon, mRNA, EST 등 사용자가 정의한 다양한 타입별 주석을 <+>, <-> 방향까지 선택해서 기재할 수 있다.
  • 보통 GBrowser 에서 Genome 서열을 가시화 시킬때 각 Gene Model 정보를 입력하기 위한 데이터 파일로 많이 사용된다.
  • 큰 틀은 유지되지만, 그래프(ex;GC contents), 블럭(ex;gene, SNP), 연결된 블럭(ex;mRNA) 등 표현해야하는 주석 타입이 다양하다보니 마지막 컬럼은 버전마다 형식이 조금씩 다르다.
  • 버전에 따라 GFF2, GFF3, 또는 GTF 와 같이 업그레이드된 포맷이 존재한다.

참고문헌 #

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