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Fixation index #
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Fixation index (고정 지수, FST)는 유전구조로 인한 개체 분화의 척도입니다. SNPMicrosatellites과 같은 유전자 다형성 데이터 (genetic polymorphism data)로부터 추정됩니다. Wright's F-statistics의 특수한 경우로 개발된 이 지표는 인구 유전학(population genetics)에서 가장 일반적으로 사용되는 통계 중 하나입니다.

정의 #

FST의 정의는 주어진 유전자 좌위 FST에 대한 가장 일반적인 정의는 개체군 간의 유전자 빈도의 차이와 혈통에 의한 개체의 확률에 근거합니다. 다른 말로, 이배체 개체에서 표본 추출 된 염색체 싸의 평균 차이 수와 개체군에서 무작위로 염색체를 표본 추출 할 때 얻는 평균수 (개인당 그룹화 제외)의 비율입니다. 목적에 따라 정의를 수정하고 개인별대신 하위 인구 집단을 고려할 수 있습니다. 인구 유전 학자들은 이 아이디어를 통해 인구 구조의 정도를 측정했습니다.

일반적으로 정의는 다음과 같습니다.

$$ F_{ST} = \frac{\text{var}(p)}{p(1-p)} $$

p = 총 인구 중 대립 유전자의 평균 빈도
var(p) = 다른 하위 집단 사이의 대립 유전자의 빈도의 변화에서 산출된 분산 값
p(1-p) = 이형 접합 자의 예상 빈도

해석 #

개체군 내 및 개체군 간 유전적 다양성의 비교는 응용 인구 유전학에서 자주 사용됩니다. 값의 범위는 0에서 1까지입니다. 0 값은 완전한 범용어를 의미합니다. 즉, 두 개체군이 자유롭게 이종 교배하고 있다는 것입니다. 1 값은 모든 유전적 변이가 인구 구조에 의해 설명되고 두 개체군이 어떤 유전적 다양성을 공유하지 않는다는 것을 의미합니다.

분석된 데이터가 매우 다형성(polymorphic)일 때 FST의 해석은 어려울 수 있습니다. 이 경우, 혈통에 의한 동일성 확률은 매우 낮으며 FST는 임의적으로 낮은 상한을 가질 수 있으며, 이는 데이터의 오류를 초래할 수 있습니다. 또한 FST는 삼각형 불평등을 만족시키지 않기 때문에 유전적 거리가 아닙니다.

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