EMBOSS
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EMBOSS #
European Molecular Biology Open Software Suite의 약자인 EMBOSS는 분자생물학자들과 생물정보학자들의 필요에 의해 만들어진 무료 오픈 소스 소프트웨어 분석 패키지이다. 이 프로그램에는 약 160여 가지의 프로그램이 통합되어 있으며, 무료로 다운받아 사용할 수 있다. 하지만 Unix나 Linux 환경에서만 프로그램이 실행가능하며, 이러한 불편을 해소하기 위해 웹상에서 프로그램을 구동시킬 수 있는 페이지도 있다.
EMBOSS의 장점 #
- 강력한 생물정보학 응용 프로그램 또는 workflow를 만들기 위해 제대로 구성된 toolkit
- 포괄적인 서열 분석 프로그램
- 모든 sequence와 많은 alignment 및 구조 포멧으로 다루어짐
- 일반적인 서열 분석 작업을 위한 광범위한 프로그래밍 라이브러리
- 문자열 처리, 패턴 매칭, 리스트 처리 및 데이터베이스 인덱싱을 포함하여 많은 다른 지역에 대한 추가 프로그래밍 라이브러리
- 무료로 사용
- 오픈 소스 프로젝트
- plus MS Windows 및 Mac OS에서는 사용할 수 없지만, 거의 모든 UNIX에서 사용할 수 있음
- 각 응용 프로그램은 하나의 마스터 인터페이스로 같은 스타일을 가지고 있고, 그 프로그램들 모두를 숙달할 수 있음
- 일관련 사용자 인터페이스로 GUI 디자이너와 개발자를 용이하게 함
- 다른 인기 있고 공개적으로 사용 가능한 패키지를 통합
- 임의의 데이터 제한이 없어서 처리될 수 있는 데이터에 제한이 없으며, 프로그래머를 위해 sequence 및 array와 같은 객체에 대한 메모리 관리가 간단함
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