EMBL #

영국에 위치한 EMBL(European Molecular Biology Laboratory)의 산하기관으로 생물정보 관련 기관인 EBI(European Bioinformatics Institute)가 있다. EBI는 EMBL DB, SWISS-PROT DB, PDB등의 생물정보학 데이터베이스를 제공하고 있다. EMBL-EBI에서는 상당히 많은 서비스를 제공하고 있다. 어떤 서비스를 제공하는지 알고 싶으면 이곳 을 클릭하면 된다.

File format #

EMBL의 파일형식은 한번에 표시된다. 표시형식은 Genbank와 유사하다. 고유번호, DNA/RNA종류, 시퀀스ID 등이 표시되고 서열의 특징과 시퀀스 포맷등이 표시된다.

ID BN000065; SV 1; linear; genomic DNA; STD; HUM; 315242 BP. XX
AC BN000065;
XX
DT 23-APR-2002 (Rel. 71, Created)
DT 14-NOV-2006 (Rel. 89, Last updated, Version 7)
XX
DE TPA: Homo sapiens SMP1 gene, RHD gene and RHCE gene
XX
KW RHCE gene; RhCE protein; RHD gene; RhD protein; small membrane protein 1;
KW SMP1 gene; Third Party Data; TPA; TPA:inferential.
XX
OS Homo sapiens (human)
OC Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Mammalia;
OC Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini; Catarrhini; Hominidae;
OC Homo.
XX
RN [1]
RP 1-315242
RA Wagner F.F.;
RT ;
RL Submitted (17-DEC-2001) to the INSDC.
RL Wagner F.F., Transfusion Medicine, University Ulm, Helmholtzstrasse 10,
RL 89075 Ulm, GERMANY.
XX
...
aaaggtacaa gtatttaaat ttaaatatac tgccaaattg ctatctaaaa tggttgtccc 314880
aatttatatt attgccgagt atgaaaatga acctttgccc ataccctccc tatgctatta 314940
tctgtcttta aaaattttat ctaatagtta agaaaatgga atctgattgg tttaatttgt 315000
atttctctaa tcagtagtta acatcttttt ctatgttttt tagccatctg tattcttttg 315060
tgactcgtaa attattttct ttagttagct ttttattgat ttgtaggagc tctttgtatg 315120
tcagggctat gaatcctttg ttttacatac attgtaaata ttttttgcca ggatgtttgt 315180
cttttatttt tgtcagcgat tctgtggaat catttgtcat ataaaagctt tcagtttgga 315240
tc 315242
//

SRS(Sequence Retrieval System) #

데이터베이스들을 통합검색할 수 있는 시스템이다. EMBL의 검색엔진으로 사용되기도 하다. 다음은 SRS에서 검색가능한 데이터베이스의 목록이다. SRS에서 검색가능한 사이트의 링크와 검색가능한 데이터베이스에 대해 알고싶다면 이곳을 클릭하면 된다.

Incoming Links #

Related Bioinformaticses (Bioinformatics 0) #

• DDBJ
• EBI
• PIR
• Swiss-prot
• UniProt 데이터베이스의 구성
• antismash
• 분자생물학 자료형

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