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Cosmic #
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Structured data

Category
Database

COSMIC #

Catalogue of Somatic Mutations in Cancer 암에 관련된 체세포 돌연변이에 대한 정보를 담고 있는 데이터베이스다. Wellcome Trust Sanger Institute에서 구축

종류 #

검색 #

COSMIC 메인 화면에 검색창이 있다. 이 검색창은 다음과 같은 검색어를 인식한다.

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  1. 유전자이름, HUHO synonym (eg.BRAF, B-raf)
  2. 조직이나 암의 종류 (long, colon)
  3. 돌연변이의 위치 및 코돈이나 아미노산변환이 들어간 설명 (c.543T>A p.D12E)
  4. 1,3번을 함께
  5. COSMIC 샘플ID나 샘플이름

검색결과 #

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검색어가 포함하고 있는 항목을 타입별로 표로 보여준다. 아래의 탭을 선택하면 각 항목에 해당하는 리스트들을 보여주며, 클릭하면 더 자세한 정보를 보여주는 페이지로 연결된다.

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유전자의 경우 Genome Browser도 함께 포함하고 있다.

데이터타입 #

  • Aberrant Gene Expression
  • CNV (Copy Number Variants)
  • Substitutions
  • Insertions/Deletions
  • Structural Variants
  • Non-Coding Variants
  • Gene Fusions

Suggested Pages #

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