Carbohydrate-Active enZYmes #

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Structured data

CAZy 데이터베이스
CAZy 데이터베이스는 glycosidic bonds의 결합, 분해, 수정에 관여하는 효소들의 구조 및 기능적 도메인 정보를 담고 있는 데이터베이스이다.
미생물에서 식물, 동물에 이르기까지 탄수화물 대사와 관련된 단백질 효소의 서열을 정보화한다.
효소 활성에 따라 1차 5개의 class로 구분되며, 이들이 다시 2차 sub-class로 구분되는 categorization 되어있다.
1. Glycoside Hydrolases (GHs) : hydrolysis and/or rearrangement of glycosidic bonds
2. GlycosylTransferases (GTs) : formation of glycosidic bonds
3. Polysaccharide Lyases (PLs) : non-hydrolytic cleavage of glycosidic bonds
4. Carbohydrate Esterases (CEs) : hydrolysis of carbohydrate esters
5. Auxiliary Activities (AAs) : redox enzymes that act in conjunction with CAZymes.

Genome이 완성되어 있으며, 종내 유전자 주석이 완료된 종들을 대상으로 CAZy database의 분류체계(classification)에 따라 탄수화물 대사에 관여하는 유전자들을 categorization 하였다.
http://www.cazy.org/Genomes.html
- Bacteria : 21,944 종
- Viruses : 457 종
- Archaea :431 종
- Eukaryota : 359 종
데이터베이스 다운로드 : http://www.cazy.org/IMG/cazy_data/cazy_data.zip