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CTD #

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  • 최초 작성자
    hspark
  • 최근 업데이트
    dongiljogun

Structured data

Category
Database

CTD #

개요 #

CTD(The Comparative Toxicogenomics Database)는 주위 환경에서 접할 수 있는 화학물질이 인체의 건강에 미치는 영향에 관한 연구를 위한 데이터베이스로 화학물질- 유전자, 화학물질-질환 및 유전자-질환 간 등의 연관성에 대한 과학적 문헌 정보를 제공하고 있으며, 유전자 기능 및 pathway 정보 등과도 연계되어 있다. 데이터베이스 검색 기능 이외에도 입력한 쿼리들 (화학물질, 질환 또는 유전자-최대 3개) 간 연관된 데이터들을 비교분석 할 수 있는 Venn Viewer, 사용자가 입력한 유전자들에 대한 CTD 데이터를 비교할 수 있는 MyGeneVeen 등의 비교분석 도구를 제공한다.

데이터 등록 현황 #

2021년 12월 기준 CTD에 등록된 데이터 현황은 아래와 같다.

Categories Number of records
Chemical-gene interactions (curated) 2,425,637
Phenotype based interactions (curated) 308,888
Gene-disease associations 29,699,944
Chemical-disease associations 3,115,260
Chemical-GO associations 6,256,816
Chemical-pathway associations 1,414,505
Disease-pathway associations 300,921
Gene-gene interactions 1,088,960
Gene-GO annotations 1,242,492
Gene-pathway annotations 135,783
GO-disease associations 2,702,936
Chemicals with curated data 16,937
Diseases with curated data 7,272
Genes with curated data 53,318
Curated references 139,505
Curated Exposure Statements 194,191
Curated Exposure References 3,189

참조 #

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