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CSA #
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Structured data

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Database

CSA(Catalytic Site Atlas) #

CSA는 단백질 데이터뱅크(PDB)의 3D 효소 구조의 활성부위와 촉매 잔기의 정보를 제공한다. CSA는 PDB ID, UniProtKB ID 또는 E.C. number로 접근할 수 있다

CSA 메인페이지

그림1. CSA 메인페이지

CSA 데이터 구성 #

CSA는 문헌을 통하여 데이터를 추출하는 방식하고 PDB 사이트 내 3D 구조정보의 상동성을 이용한 방식으로 데이터를 구성한다.특히 PDB의 Homologous entries는 SI-BLAST를 사용하여 원래의 entry와 cutoff(evalue - 0.00005)을 만족할 경우 사용한다.

CSA 데이터 생성 방법

그림2. CSA 데이터 생성 방법

출처 #

http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/CSA/

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