CGH(comparative genomic hybridization) #

CGH의 정의 #

비교 게놈 혼성화(comparative genomic hybridization)의 특정 염색체 이상에 대한 사전 지식없이 전체 게놈에 걸쳐 DNA의 카피 수 손익의 검출을 가능하게하는 기술이다. 비교 게놈 혼성화 종양에서 게놈 DNA 카피 수 변화의 맵을 생성하는 차분 기준 및 종양 표지 DNA의 혼성화를 이용한다. CGH 결과가 보관 된 종양 물질에 염색체 불균형을 분석하고 이러한 연구 결과 종양 표현형 사이의 가능한 상관관계를 조사하기 위한 이상적인 도구이다.

대표적으로 암 질환들을 연구하는데 사용되는데 암뿐 아니라 여러 질환들을 살펴보아 특정 유전자의 과발현이나, 과소발현에 의하여 발생하는 경우도 있지만, 최근에는 염색체상의 유전자 수가 증폭되거나 결실되어 특정 유전자의 발현이 증가 또는 감소로 인한 질병의 발병에 대한 연구가 활발히 진행되고 있다. 이는 DNA microarray를 이용하여 다양한 암으로부터 유전자 발현변화를 mRNA level에서 조사하는 방법과 더불어 새로운 질병연구의 도구로 이용되고 있다.

array CGH #

array CGH는 수백개 또는 수천개의 표적클론(targeted clone, BAC or oligonucleotide)을 고정 시킨 슬라이드에다 환자와 대조군의 DNA를 경쟁적으로 혼성화시켜서 유전자의 양적인 증감을 분석하는 기법이다. 통상적으로 염색체 검사는 세포배양을 통해 약 5Mb 이상의 해상도에서 염색체를 분석하는 반면에, array CGH는 배양을 거치지 않고 표적클론의 크기에 따라 고해상도에서 동시에 수 천개 이상의 유전자 분석이 가능하다. 그러나 다량의 유전자 분석결과를 토대로 비정상적인 표현형과 관련된 결과와 유전적 다양성에 의한 결과를 구분하는 해석상의 어려움이 남아 있다.

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