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Bonferroni correction #
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Bonferroni correction은 다수를 비교할때 발생되는 오류를 보정하는 통계추론 방법 중 하나이다. 이 방법의 통계적인 의미는 위키피디아에 잘 정리되어져 있다.(http://ko.wikipedia.org/wiki/%EB%B3%B8%ED%8E%98%EB%A1%9C%EB%8B%88_%EA%B5%90%EC%A0%95). 이러한 방법은 생명공학분야에서 질병과 유전자의 연과성을 연구(GWAS)하는데도 많이 활용되고 있다.

GWAS분석에서의 Bonferroni correction #

GWAS분석에서 과거에는 한 두개의 유전자 또는 유전변이형 마커에 대한 연관성 분석을 수행하였기때문에 다중비교(Multiple comparison)에 의한 오류는 큰 문제가 되지 않았다. 그러나 최근에는 엄청난 수의 유전변이형 마커가 질병 연관성 연구에 활용되면서 다중검정의 문제가 제기되었다. 이러한 문제를 해결할 수 있는 방법으로는 가장 간단한 bonferroni correction방법을 많이 활용한다. 이 방법은 유의수준 α(= p-value)를 총 검사한 개수(N)로 나누어 주는 것이다. 예를 들어, 단일검사의 유의수준(False positive율)을 5%로 설정하면 Bonferroni correction에 의한 새로운 유의수준 α(=p-value)= 0.05/N으로 표시된다.

단일검사의 false positive = α = 5%    : family-wise type 1 error(FWE)
P-value = α = 0.05/N, where N = No. of tests : test-wise error rate(TWE)
No. of tests: 1test 10test 100tests
p-values:     0.05  0.005  0.0005

위의 보기에서와 같이 조사하는 개수가 증가함에 따라 유의수준이 급격히 감소함을 알 수 있다. 따라서 본 보정 방법은 수행하는 검사의 수가 많은 경우에는 너무 엄격하게 유의수준이 크게 감소한다는 단점을 가지고 있다.

Reference #

  1. Dunnett, C. W. (1955). A multiple comparisons procedure for comparing several treatments with a control. Journal of the American Statistical Association, 50, 1096-1121.
  2. 이종극(2006). 질병 유전체 분석법

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