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Biopython GeneWise #
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GeneWise #

GeneWise는 단백질 서열과 Genome (nucleotide) 서열간의 Alignment를 수행할때 사용하는 Alignemnt 도구로써 단순 Alignment 에서 벗어나 Alignment이후 유전자 모델을 제시하며 특히 Splice site을 인식한 유전자 모델을 제시한다. Genewise는 Genewise의 속도 및 서열길이의 제한점 및 메모리 사용의 한계점을 극복하고자 새롭게 개발된 Exonerate와 함께 주로 비교되며, HMM을 이용한 학습 및 예외처리와 같은 정확성 등의 이유로 Exonerate로 완전히 대체 되지는 못하고 있다.

genewise web site #

관련페이지 #

*Exonerate : http://www.ebi.ac.uk/~guy/exonerate/beginner.html

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