BioEdit
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BioEdit #
BioEdit이란 #
BioEdit은 DNA sequence를 편리하게 정리하고 분석하기 용이한 프로그램이다. Gene이 가지고 있는 DNA는 너무도 많고 복잡하기 때문에, 이를 정리하는 것은 쉬운 일이 아니다. 하지만, BioEdit은 누구나 쉽게 DNA sequence를 정리할 수 있게 해준다. DNA sequence 뿐만 아니라, 해당 DNA sequence의 translation된 형태, 즉 amino acid sequence로도 변환이 가능하여 amino acid의 정리도 가능하다.
BioEdit의 기능 #
BioEdit은 단순히 sequence의 정리에만 그치지 않는다. 원하는 DNA 또는 amino acid sequence들을 alignment시켜 sequence차이를 확인 할 수 있고 DNA의 5' 과 3'의 위치를 바꾸어 정리도 가능하여 사용자의 입맛에 맛게 sequence의 정리가 가능하다. 또한, 원하는 sequence상에 nuclease site가 있는 지 확인하는 기능, cloning을 통해 구축한 plasmid의 sequence를 vector map으로 손쉽게 그릴 수 있는 기능, DNA나 amino acid의 composition 확인, BLAST, hydrophbicity profiling, Entropy prediction 등 다양한 기능을 포함하고 있다.
BioEdit 다운로드 #
BioEdit은 약 20MB의 적은 용량만을 필요로 하며, 저사양의 컴퓨터에서도 부담없이 많은 기능을 사용할 수 있는 프로그램이다. 아래의 출처를 따라가 좌측의 BioEdit.zip(Full install)버튼을 눌러 다운로드 할 수 있다.
BioEdit 다운로드 출처: http://www.mbio.ncsu.edu/bioedit/bioedit.html
BioEdit을 이용해 사용자가 쓸 수 있는 기능들을 정리해 놓은 매뉴얼도 배포되어 손쉽게 원하는 기능들을 찾아볼 수 있다.
BioEdit 매뉴얼 출처: http://www.mbio.ncsu.edu/bioedit/biodoc.pdf
