Introduction #

BactoGeNIE는 NGS의 application인 Comparative genome analysis를 large-scale로 수행하는 도구다. 단순한 visualization일지 모르는 이 도구는 'comparative gene neighborhood analysis'를 추구한다.

BIG PICTURE #

위 사진은 E.coil의 700 strains에 대해서 Neighborhood around a hypothetical protein 을 확인하는 장면이다. display는 at 21.9 by 6.6 feet and 6144 by 2304 pixcels이다.

characters #

각각의 genome은 한 행에 하나씩 배열되며 배열된 모든 genome의 Alignment를 통해 Comparative genome analysis를 수행한다. 수행이 완료되면 각각 유전체의 특징적 단위가 화살표로 표시되며 Break, Deletion, insertion, gap 등등이 표시된다.