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BOLD #
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Structured data

Category
Database

BOLD #

BOLD(the Barcode Of Life System) #

Image [BOLD System, 메인화면]
BOLD는 DNA 바코드 정보의 수집, 저장, 분석을 위한 정보를 제공하는 데이터베이스이다. DNA 바코드에 관심이 있는 모든 연구원이 자유롭게 사용할 수 있으며, 전문적인 서비스를 제공한다. 국제생명체바코드(International Barcode of Life, iBOL)협회에서 지금까지 중에서 가장 대규모의 생물다양성 유전체학 프로젝트를 선언했다. 그리고 현재까지 생명체 바코드 데이터베이스(Barcode of Life Database, BOLD)에 약 1200만개의 표본과 26만개의 이름 붙은 종들을 수집해 넣었다.
또한 BOLD는 보유하고 있는 DNA 바코드 정보를 이용해 BLAST 프로그램으로 생물 종을 감식할 수 있는 서비스를 제공하고 있다.

보유하고 있는 시퀀스 (2017-09-07 현재) #

시퀀스 종류 시퀀스 수
Barcode clusters for animals(BINs) 517,557
All Sequences 6,529,044
Barcode Sequences 5,665,970

보유하고 있는 데이터의 종 수 #

데이터 종 종 수
Animals 179,712
Plants 66,013
Fungi & Other Life 20,980

BOLD의 데이터베이스 #

BOLD는 DNA 바코드 관련 정보 뿐만 아니라 아래와 같은 데이터베이스를 통해 다양한 정보를 제공하고 있다.

1. Public Data Portal
 : 다양한 조건으로 검색가능하고 지역,계통 정보 등을 포함하는 170만개 이상의 데이터를 제공

2. BIN Database
 : 바코드 인덱스 넘버(BIN)로 검색이 가능하며, 종에 근접하는 시퀀스 클러스터의 데이터베이스

3. Publications
 : 바코드 정보를 활용한 바코드 publication 데이터베이스

4. Primer Database
 : 바코드 시퀀스 생성에 사용되는 프라이머를 모아놓은 데이터베이스

BOLD에서 제공하는 분석도구 #

1. Identification
 : Animal(COI), Fungal(ITS), Plant(RBCL&MATK)의 바코드 식별을 위한 도구 제공

2. Taxonomy
 : Taxonomy 정보를 검색할 수 있으며, 각 종의 이미지 정보와 더불어 해당 생물이 분포해 있는 지역에 대한 정보를 지도상에서 구체적인 위치정보로 확인할 수 있는 분포 지도 정보를 제공하고 있다.
   - Specimen Records : 7,743,594
   - Specimens with Barcodes : 5,665,970
   - Species with Barcodes : 266,705

3. Workbench
 : DNA 바코딩 데이터의 manage, archive, mine, analyze, publish, share 하기 위한 기능을 제공하고 있다. (사용자 등록 필요)

Referense #

도서 '바이오코드' (저자 : 던필드, 닐 데이비스)

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