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Artemis #
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Structured data

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Software

wellcome trust sanger institute에서 제공하고 있는 NGS데이터의 시퀀스 정보들을 시각적으로 확인할 수 있고 주석을 관리해주는 도구 및 genome browser를 제공하며 GUI 버전도 제공해주는 무료 툴이다. Java로 실행이 되며 윈도우, 리눅스, 맥 모든 OS에서 실행이 가능하다. 무료인만큼 우수한 그래픽을 가지지 않았으나 간편하게 그래픽 형태로 genome을 볼 수 있는 것이 장점이다. 시퀀스파일 및 EMBL, GENBANK, GFF, VCF 포맷 등을 인식할 수 있다.

Image
[그림1] Artemis 실행 화면

Standard mode에서 viewer뿐 아니라 간단히 ORF정도 표기해 줄 수 있고, NCBI Blast, Pfam/Rfam db를 이용한 도메인 검색,GC contents 그래프 등을 그려줄 수도 있다.

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