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AgriGO #
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Structured data


GO Analysis Toolkit and Database for Agricultural Community (AgriGO) #

AgriGO는 gene ontology 분석을 위한 web-based tool 및 database로 특별히 작물종 (gricultural species)에 한해 사용자 편의를 제공하는 프로그램


가능 분석 #

  1. PAGE (Parametric Analysis of Gene set Enrichment)
  2. BLAST4ID (Transfer IDs by BLAST)
  3. SEACOMPARE (Cross comparison of SEA)

결과 포멧 #

  1. HTML tables
  2. tabulated text files
  3. hierarchical tree graphs
  4. flash bar graphs.

유용성 #

  1. agriGO, PAGE and SEACOMPARE는 모두 다른 종간의 분석이 가능하며 time-course 실험과 같은 multiple groups of experiments도 분석이 가능함.
  2. 생물 45종과 데이터타입 292 종이 현재 서비스중.

Reference #