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16s rRNA #
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Biology

16s rRNA #

16S rRNA 유전자는 bacteria나 archea에서 발견되는 prokaryotic DNA이다. 이 rRNA는 Ribosome을 구성하고 있다. rRNA의 첫글자의 r이 바로 이 ribosome을 의미한다. Ribosome은 큰부분(large subunit, LSU)과 작은 부분(small subunit, SSU)으로 나뉘어져있는데 이 두 개의 subunit이 샌드위치처럼 mRNA를 끼워서 translation을 한다.

16s rRNA 동정목적 #

16S rRNA는 일반적으로 bacteria의 동정에 사용되는데 이에는 몇가지 이유가 있다. 첫째, 전통적으로는 bacteria의 분류는 그람(gram) 양성/음성 혹은 간균,구균 등의 phenotype적인 특징에 의해 결정되었다. 하지만 요즘 분류학자들은 생물의 DNA가 phenotype보다 동종에 더 중요하다고 여긴다. 둘째, 16s rRNA는 1.5kb정도로 비교적 짧기 때문에 적은 비용으로 시퀀싱이 가능하다.

따라서 metagenomics에서는 미생물의 16s rRNA를 이용하여 특정 환경에 존재하는 미생물들을 동정한다.

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