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항생제내성 데이터 및 관리 항목 #
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Structured data

Category
Biology

개요 #

현대의 필수 의약품으로 자리잡고 있는 항생제에 대해 내성을 가진 내성균의 출현으로 항생제 내성(Antimicrobial resistance, AMR)은 국내 뿐만아니라 전 세계적으로 공중보건에 상당한 위협이 되고 있다. 특히 여러 항생제에 내성을 보이는 다제내성균의 확산으로 사망률 및 치료기간, 의료비용 등의 증가로 공중보건 위협 뿐만 아니라 사회경제적 손실을 초래할 수 있다.

그러나 2003년부터 2012년까지 국무조정실 총괄의 국가 항생제 내성 안전관리 사업 이 후 특별한 컨트롤 타워 없이 부처별로 분절적 대응이 이어져 왔으며, 내성균의 경우 사람 뿐만 아니라 농축수산, 식품, 환경 등의 다양한 생태계 경로를 통해 발생 및 전파가 가능하기 때문에 포괄적을 관리가 필요한 실정이다.

항생제 내성 관리에 대한 고민은 국내 뿐 아니라 국외에서도 진행되어 왔으며, 2015년 5월, 68차 세계보건총회에서 항생제 내성이 인류 보건에 심각한 위협이라는 전 세계적 요구에 따라 국제적인 대응을 촉구하는 항생제 내성 국제 행동계획(Global Action Plan on Antimicrobial Resistance)을 채택하였다. 또한 항생제 내성 국제 행동계획의 5대 전략적 목표 중 하나인 '국제적 감시 및 연구 확대를 통한 증거 기반 강화' 목표를 지원하기 위해 국제 항생제 내성 감시체계(Global Antimicrobial Surveillance System, GLASS)를 개발하여 표준화된 항생제 내성 자료를 수집·분석하여 여러 국가들과 함께 공유하고 있다.

WHO Global Antimicrobial Surveillance System(GLASS) #

국가들 간의 공유를 위해 GLASS에서는 항생제 내성 데이터에 대한 표준화된 형식을 제공하고 있다.

GLASS 수집 데이터 파일 유형(file format) #

GLASS에서는 수집하는 데이터의 파일 유형은 아래와 같이 두 가지로 구분된다. 두 파일 모두 Microsoft Excel을 통해 생성할 수 있으며, CSV의 경우 tab으로 구분된 파일이 아닌 comma로 구분된 파일만 업로드 받고 있다.

  • tab-separated(tab-delimited) TXT file
  • comma-separated CSV file

GLASS 제출 파일 종류 #

RIS file #

RIS 파일은 감수성 실험 결과 파일로 GLASS에서 제공하는 정형화된 형식에 맞춰 작성 및 제출하여야 한다. RIS 파일 데이터 항목은 resistant, intermediate, susceptible의 수나 추출한 검체정보, 성별, 감염경로 등을 수집하고 있으며, 전체 수집항목은 아래와 같다.

RIS 수집 항목 유형 예시
COUNTRY Coded value AFG
YEAR Coded value 2015
SPECIMEN Coded value BLOOD
PATHOGEN Coded value ACISPP
GENDER Coded value M
ORIGIN Coded value HO
AGEGROUP Coded value 01<04
ANTIBIOTIC Coded value AMK
RESISTANT Integer (≥0) 15
INTERMEDIATE Integer (≥0) 10
NONSUSCEPTIBLE Integer (≥0) 5
SUSCEPTIBLE Integer (≥0) 30
UNKNOWN_NO_AST Integer (≥0) 5
UNKNOWN_NO_BREAKPOINTS Integer (≥0) 0
BATCHID Coded value DS1

Image

RIS 파일 예시 (출처 : WHO GLASS)

Sample file #

Reference #

0.0.1_20140628_0