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생물정보 데이터 형식
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Structured data
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- Analysis
서열, Gene Model(annotation), 다중서열정렬, 계통도, Mapping 등 생물학적 데이터를 나타내는 다양한 형식이 존재하며, 데이터를 공유하는 데 있어서 이러한 데이터 형식을 이해하고 준수하는 것이 중요하다.
각 데이터의 포맷은 아래의 이미지를 통해서 확인할 수 있다.
형식 #
FASTA #
GFF #
출처 : https://github.com/The-Sequence-Ontology/Specifications/blob/master/gff3.md
Genbank #
출처 : https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MK607721.1?report=genbank
FASTQ #
SFF #
SAM/BAM #
[BAM 파일 형식]
출처 : https://bio-info.tistory.com/26
VCF #
출처 : https://en.wikipedia.org/wiki/Variant_Call_Format
ALN #
PHY #
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- 0.025 aln
- 0.025 sequence
- 0.025 SAMtools
- 0.025 Roche
- 0.025 Multiple Alignment
- 0.025 계통수
- 0.025 BWA
- 0.025 변이
- 0.025 아스키 코드
- 0.025 Ion Torrent
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