생물정보동향2016-0504호
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바이오 및 생물정보 동향 (2016-0504호) #
- 5월 넷째 주는 주로 스마트팜에 대한 정보를 정리해보았습니다. 국내에서 스마트팜 서비스를 출시한 KT의 소식도 있습니다.
- 또한, 오바마 정부의 마지막 프로젝트로 국가 마이크로바이옴 이니셔티브를 발표했는데, 미생물 메타지놈에 대한 연구가 더욱 확대될 것으로 예상됩니다.
유전체 및 생물정보 이슈 #
한국경제신문 16.05.13 |
[이슈] 오바마의 마지막 프로젝트, 미생물 • 농업·인간에 미치는 영향 연구에 약 1400억원 투자, 미생물 유전자 해독 통해 질병 원인·치료법 찾는다 • 우리 몸에 사람의 세포(1-조개)보다10배 많은 100조개의 미생물 존재 • 2007년부터 2000억원의 예산이 투입된 HMP는 미국인 242명의 코와 피부, 입, 소장 등 18개 신체 부위에서 미생물을 채취해 유전체 분석을 완료 • 오바마 미국 행정부는 지난 13일 임기 마지막 대형 과학프로젝트로 '국가 마이크로바이옴(microbiome·미생물군집) 이니셔티브'를 발표 [이슈] • 농작물과 소, 돼지 등에 영향을 미치는 토양미생물을 비롯해 감염병과 정신질환, 비만에 영향을 미치는 미생물, 우주인에게 미생물이 미치는 영향을 연구하는 이 사업에는 2년간 1억2100만달러(약 1440억원)가 투자될 예정 • 이에따라 메타지놈 연구의 활성화가 더욱 박차를 가할것으로 생각되며 이를 해석할수 있는 Qiagen Micorobiome Genomics Solution을 통해 미생물 유전체 분석을 쉽고 빠르게 해줄 수 있을 것으로 예상 |
머니투데이 16.05.25 |
[이슈] 미래부, 바이오시장 2,100억 투자 결정 • 정부, 바이오기술 스타트업 및 성장기업 자생적 생태계 구축을 대규모 지원 • 제2차 바이오특별위원회 열어 바이오 중기(2016~2018년) 육성전략 발표 • 바이오 산업 규제 및 코스닥 상장기준 완화 • 생명연구자원 통합관리체계 구축 [오피니언] • R&D개발 주기가 긴 바이오 산업의 특성에 맞춘 지속적 노력 및 투자 필요 • 바이오 기업들의 자생적 생태계 조성 • 선진국형 창업-성장-투자회수-재투자 까지 역동적 선순환 고리 형성에 노력 |
바이오 산업 #
전자통신동향분석 smart-farm.blogspo |
스마트팜 기술동향 및 전망 • 우리나라 농업은 농촌인구 감소 및 고령화, 곡물자급률하락, 농가 소득 정체, 한반도 기후변화 심화 등으로 어려운 상황 • 수입 농산물이 매년 증가하고 있고 국내 농경지도 지속적 하락으로 인한 농업 활성화 대책 필요 • 현재 선도농가 중심으로 최신 ICT 융합 스마트팜을 딸기, 토마토, 파프리카 재배에 일부 적용 [국내외 정책동향] • EU, 정밀농업분야에 대한 농업 ICT 융합연구개발인 국제 공동연구 프로젝트(EU ICT-AGRI) 진행 • 네덜란드, 산학협력을 통한 그린포트와 시드밸리 원예산업 클러스터 단지 조성 • 일본, 정부차원에서 농업ICT 융합 기술개발 적극 지원(2014년부터 정부&기업 공동프로젝트 추진) • 우리나라, 과학기술기반 농업혁신 전략보고회를 통해(2014.12) 한국형 스마트팜 개발하여 2017년까지 영세농가 8,000가구 대상 제공키로 함 - 농림축산식품부, 스마트팜 지원위해 2015년 예산 216억 확보하여 시설원예 및 종돈장에 투입 예정 [국내외 시장 동향] • 통계청 보도에 따르면 세계 인구는 2015년 73억명이며, 2060년 99억명으로 35% 급증 예상 • 현 농업 생산방식으로는 식량수요 충족 불가능하여 첨단 기술 활용한 농업 필요 • 네덜란드는 우리나라 면적의 1/2이지만 첨단 ICT를 융합한 스마트 농업을 통하여 세계 2위의 농산품 수출국 • 일본의 스마트 농업 시장 규모도 2013년 66억엔 에서 2020년 308억엔으로 확대 전망 • 농진청은 SKT, KT와 스마트팜 시범사업 추진 중 • 대표적 스마트팜 성공사례인 전남 화순 한울농장은 기존보다 40% 이상 생산성 향상, 관리시간 역시 4배 이상 편리해지고 에너지 절감도 35% 달성 [국내외 기술동향] • 미국 농업은 IoT 기술, 나노기술, 빅데이터&클라우드 기술, 로봇기술에 접목 • 구글X프로젝트팀 - 토양 수분 작물건강에 대한 데이터 수집 - 기후 악화시에도 생산량이 유지 또는 증가하는 작물품종 개발 - 드론을 이용한 작물 모니터링 관리 - 나노농약, 나조제초제, 나노센서 및 감별기 기술 개발 • 우리나라 스마트팜 기술의 주요 제품은 현재 대부분 외산 구입하여 시스템 구축하는 수준 임 • 제품 가격 및 운용&유지 보수 비용이 크고 AS가 어려운 상황 • 현재 스마트팜 시스템은 주로 스마트 미디어를 통한 원격제어(개폐, 관수, 보일러 작동 등), 현장 영상 및 환경정보 제공등으로 농민 편리성은 있으나 생산성 및 품질 향상에는 미흡 |
Priva 사의 온실환경제어시스템 설치 사례 Wageningen UR의 오이 자동수확 로봇 Hortimax 사의 복합환경제어기 출처: ETRI |
스마트팜의 국내외 산업 동향 [네덜란드] • Piva 온실에서 작물이 필요로 하는 온도, 습도, 조명, 영양요소를 관리하는 온실환경제어시스템 및 양액자동제어시스템 개발 보급 기업 • 온실의 환경제어 기술을 기반으로 빌딩의 내부 환경과 에너지 소비량 관리 가능한 시스템 개발하여 현재 네덜란드 공공건물의 약 30%에 적용 • 와헤닝헌 대학 연구센터는 네덜란드 농업자연식품부의 연구비 지원받아 오이를 자동수확할 수 있는 로봇 개발 • 온실환경에서 잘 익은 오이를 95% 정확도로 판별하고 75%를 수확 • Hortimax는 온실의 복합환경제어기를 개발 및 생산하는 회사로 우리나라에도 파프리카 재배 농민들이 주로 적용하고 있음 [일본] • 후지쯔, NEC, IBM, NTT 등 유수 기업들이 농업 분야에 ICT 기술 접목하여 다양한 서비스 제공 • 후지쯔 농업관리 클라우드 서비스인 아키사이는 IoT 센서를 이용하여 재배환경의 데이터를 실시간 계측, 수집, 분석하여 작물 재배에 활용 [우리나라] • 우성하이텍, 국내 온실조건에 적합하도록 환경제어가 가능한 시스템, 시설원예 원격제어시스템, ICT 복합환경 시스템, 자연환기시스템 등을 개발하여 보급 |
전남일보 2016.05.26 |
[이슈] KT, IoT 통한 GiGA 스마트팜 서비스 출시 • KT는 설비 구축 비용을 최대 40%까지 줄여주고 온실시설 제어 성능을 대폭 향상시간 서비스 출시 • 센서가 달린 사물인터넷 기기를 통해 재배시설의 온도, 습도, 일사, C02 및 토양을 분석하고 그 결과에 따라 제어장치 구동 솔루션 • 농식품부의 스마트팜 가속화 대책과 연계해 스마트팜 도입 농가의 ICT 기술 사용의 어려움 및 AS 문제 해결을 위해 스마트팜 실습교육장 및 지원센터 전국 10개 개설 [오피니언] • 빅데이터 기반으로 농업기술의 선진화를 이루어 가고 있는 상황에서, 유전체 정보를 활용한 작물 품종 개선 및 생산성 확대를 위한 노력 필요 |
학술/사설 #
Nature Communications 2016.05.13 |
장내 미생물 유전자의 장 관련 감염 질환 유도 원리 규명 • 숙주의 저항력을 감소시키는 원인 미생물과 유전자를 찾아내 장 관련 질환의 새로운 바이오마커를 제공 [연구내용] • 암피실린, 반코마이신, 스트렙토마이신 및 클린다마이신 등의 광범위 항생제에 처리된 실험용 쥐가 대표적 병원성세균 중 하나인 콜레라균에 의한 감염에 매우 취약해 지는 것을 확인 • 항생제의 복용이 장내 마이크로바이옴에 미치는 영향을 확인하고, 다양한 장내 세균 중 콜레라균과 상호 작용하는 단일 세균 종(대장균)을 분리 동정 • 균주의 전체 유전체(whole genome) 분석을 통해, 동정된 대장균이 기존의 대장균과는 상이한 특징이 존재함을 밝혀냄 • 항생제에 반응하는 장내 미생물 분석을 통해 장내 공생미생물의 변화를 관찰하고 특정 유전자가 장내 환경을 변화시키고 그 결과 감염성 세균의 증식을 유도한다는 사실을 확인 [오피니언] • 항생제 오용으로 발생하는 장 관련 감염 질환의 진단 및 치료에 기여할것으로 예상 • 특정 유전자를 규명함으로서 이후 관련 질환에서 확인 및 제어를 통해 항생제에 의해 발생하는 장 질환의 치료 방법을 찾는데 중요한 계기가 될 것으로 기대 |
사업공고 #
미래창조과학부 공고 |
• 2016년 바이오 의료 기술개발사업 신규과제 선정 재공고 • 접수기간: 5월 26일(목) ~ 6월 7일(화) • 신청방법: 온라인 (https://ernd.nrf.re.kr/) • 담당자 전화: 042-869-7759(연구소재지원사업) |
생물정보 솔루션 소식 #
BIOBAM, BlattoGO |
[소식] 3.3 버전으로 업데이트 2016.05.17 [기능] • Local database를 만들고 이 database로 blast를 수행하기 용이 • Annotation 단계 진행 시 새로운 필터를 적용 • Blast2GO App Manager에서 Blast2GO에 새로운 툴을 추가 가능 • PSORTb 3라는 app을 이용하여 박테리아의 단백질 subcellular localization annotation 예측이 가능 • Generic table column의 distribution chart(dot, bar, line) 생성 가능 • LAT 알고리즘을 이용하여 큰 데이터셋 내에 있는 유사하거나 불필요한 시퀀스를 찾고 삭제 가능 |
QIAGEN, New RNA-Seq solution |
[소식] QIAGEN, New RNA-Seq solution - Best performance at CAGI 2016.05.16 [기능] • CACI에서 최고 성과 창출 • 확실한 통찰력을 위한 새로운 RNA-seq 솔루션 • Genome assembly와 해석 가능 |
