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Posts 생물정보동향 2016-1001호 #
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바이오 및 생물정보 동향 (2016-1001호) #

  • 10월은 가을의 향기와 아름다운 단풍이 물든 풍요로운 결실의 기간이었습니다.
  • 2016년 인실리코젠, KOBIC 제 34회 교육이 결실을 거두며 한해의 교육이 마무리 되었습니다.
  • 네이처에 혹평을 받으며 한국인 유전체 해독이 정확하게 되기도 하였고, 아프리카발톱개구리의 유전체도 해독외에 네이처에 발표되었습니다.
  • 바이오분야에서는 지난 9월 정밀의료 관심에 이어서 여러 대학병원들이 차세대 먹거리 사업으로 헬스케어 사업에 주목한다는 기사와, 게놈프로젝트에 한국이 뒤쳐졌던 지난 일을 반성하면서 뇌과학 지도 연구개발에 주력을 기울인다는 기사도 있엇습니다.
  • 한편, 홍채인식이라는 신기술로 관심을 모았던 삼성 갤럭시노트 7 단종이 전세계적으로 이슈가 되었던 기간이기도 하였습니다.

  • 키워드로 보는 10월 동향: KOBIC 차세대 생명정보 교육, 에피지노믹스, 한국인 및 아프리카발톱 유전체 해독 네이처 발표, 헬스케어 사업, 갤럭시노트7


유전체 및 생물정보 이슈 #

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* 사이언스온 16.10.06*
[이슈]
한국인 유전체 완벽 해독..."세계에서 가장 정확"
• 현재까지 나온 인류 유전체 해독 결과를 통틀어 가장 적확하다는 평가
• 서정선 서울대 의대 유전체의학연구소장과 국내 생명공학기업인 마크로젠의 연구진 등은 한국인의 유전체 서열을 거의 완벽하게 해독
• 국제학술지인 '네이처' 10월 6일자에 '특집 논문'으로 게재
• 한국인 염기 서열을 기존 100배 길이로 정확하게 읽어내는 기법을 적용해 공백으로 남았던 유전체 정보 190곳 가운데 절반이 넘는 105곳을 완전히 해독
• 이와 함께 한 사람이 어머니와 아버지로부터 각각 어떤 유전자를 받았는지도 구분하는 성과도 창출
• 한국인의 유전체를 해독하며 암 억제 유전자와 피부색 관련 유전자 등 다양한 유전자에서 한국인만의 특성이 있는 것을 찾아냄

[오피니언]
• 개인의 유전체 정보를 바탕으로 질병을 예측하고 진단하며 치료하는 정밀의학의 기술적 주도권을 한국이 선점했다는데 이번 연구의 의의
• 한국인 체형에 맞는 신약개발에 큰 기여
• 한국인 유전체 데이터 기반의 생물정보 분석 수요의 확대 예상
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질병관리본부 유전체센터 16.10.10
[이슈]
한국인 인체 유래 원시세포를 이용한 에피유전체 연구 동향
• 고령화를 대비한 맞춤의료 실현은 미래 대응을 위한 창조 연구와 보건의료 융복합 신기술 개발 등 국내 보건의료 연구의 중장기 비전에 부합하는 원시세포의 에피유전체 분야의 연구 동향
• 피유전체 연구에서 로드맵이 될 수 있는 참조유전체 데이터로써 원시세포의 에피유전체 지도작성에 관한 최신 연구 동향

국내 원시세포(primary cell) 관련 정책 및 연구 동향
• 보건복지부와 국립보건연구원에서 한국인체자원은행사업을 추진하고 있으며 소속 17개 인체자원단위은행과 중앙은행(충북 오송)을 통하여 현재 수집한 50만 명분 한국인 인체자원을 분양하고 한국인체자원은행사업(Korea Biobank Project)의 수요자 맞춤형 분양시스템을 구축하여 One-stop 분양이 가능한 온라인 분양 포털을 구축
1) 한양대학교 [에피유전조절에 의한 세포기능분석 연구센터]: 국가지정 과학연구센터(SRC)로 지정되어 에피유전체 연구자 간 협력 연구를 수행
• 2) 한국생명공학연구원 [유전체연구센터]: 줄기세포의 분화 관련 유전자의 동정 및 유전체 조절기전 규명, TM4SF4 유전자의 DNA methylation에 의한 발현조절 및 항-TM4SF4항체에 의한 암세포 성장억제 규명
• 3) 국립보건연구원 유전체센터 [형질연구과]: 국제인간에피유전체컨소시엄(IHEC)에 가입, 한국인 에피유전체 정보생산

해외 원시세포(primary cell) 연구 동향
• IHEC(International Human Epigenome Consortium)
• TCGA (The Cancer Genome Atlas)

[오피니언]
• 한국인으로부터 유래한 원시세포를 이용하여 한국인 특이적인 에피유전체적 정보를 생산하고, 이를 통하여 한국인의 질병 또는 질병에 대한 치료에 적합한 연구 데이터를 제공
• 국제적 컨소시움 참여를 통하여 유명한 연구기관과의 긴밀한 네트워크를 구축하고 각 기관과의 협업을 통하여 높은 질의 연구 성과를 기대
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뉴스1 16.10.20
[이슈]
'실험동물' 아프리카발톱개구리 유전체 해독
• UNIST 연구진이 100여년간 실험동물로 각광받아온 ‘아프리카발톱개구리’의 유전체를 해독
• 아프리카발톱개구리의 유전체와 4만여 개의 유전체를 염색체 수준으로 규명하고 이를 20일 ‘네이처’에 발표
• 염색체 그룹이 4개(4배체)여서 분석이 까다로와 다른 동물보다 유전체 해독이 느렸음
• 권태준 교수는 “아프리카발톱개구리는 4개 유전체 그룹으로 이뤄진 독특한 동물이라 유전체 정보가 제한적으로만 알려져 있었다”며 “이번 유전체 해독으로 생물학 전반에 쓰일 효과적인 실험동물 모델 시스템을 구축할 수 있게 됐다”고 발표
• 아프리카발톱개구리는 4개 유전체 그룹에서 각각 9개의 염색체를 가지며 연구진은 이들 염색체의 DNA 반복서열을 분석해 크기가 큰 L염색체 9개와 크기가 작은 S염색체 9개가 각각 다른 종에서 유래했다는 것 밝혀냄

[오피니언]
• 암 등의 인간질병 연구하는 새로운 모델 기대
• 진화를 통해 새로운 유전자가 생성되는 과정과 같은 기초 연구뿐 아니라 암이나 선천성 기형처럼 배체수 변화가 흔히 나타나는 질병 연구에도 도움이 될 것

바이오 #

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* YTN 16.09.27*
[이슈]
박근혜 대통령이 방한한 루터 네덜란드 총리와 정상회담을 열고 양국 간 협력 강화를 위해 양해각서 5건 체결
• 네덜란드가 강점을 가진 빅데이터와 바이오 분야의 협력 강화
• 네덜란드의 빅데이터 활용과 분석기법을 도입하면 속보성 경기동향 통계 작성이 가능해져 소비자심리지수와 GDP 선행지표를 매일 만들 수 있을 것으로 전망
• 인적·물적 교류를 활성화하기 위해 양국 간 투자 기업을 서로 지원하고, 두 나라 경제인 단체를 통한 민간경제협력위원회를 정례화
• 난 2년 동안 시험 운영돼온 워킹 홀리데이 프로그램을 공식화해 양국 학생들의 교류 범위를 늘리자는 데에도 뜻을 모음
• 농업인 교육 프로그램 등을 토대로 농엽 협력 분야를 스마트 농업으로 넓히기로 했음

[오피니언]
• 청와대는 양국 정상이 이번 만남을 통해 경제 협력 확대 말고도 대북 공조를 한 단계 강화하는 계기를 마련한것으로 밝힘
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* 뉴스1 16.09.28*
[이슈]
한국, '뇌지도' 연구 나선다
• 선진국들은 새로운 블루오션으로 '뇌지도'에 주목하고 있음, 1,000억개의 신경세포(뉴런)로 구성된 신경망을 밝히고 재구성하는 뇌연구 프로젝트에 전세계의 두뇌들이 모여들고 있음
• 4차 산업혁명의 핵심인 인공지능(AI) 개발에도 뇌연구는 필수
• 컴퓨터 및 소프트웨어 분야로 간주된 인공지능 연구의 발달도 뇌연구를 촉진시키고 있고, 인공지능(AI)의 궁극적인 지향점이 결국 인간의 '뇌'
• 뇌연구는 신경과학, 뇌질환, 뇌공학, 뇌인지 등 크게 4가지 분야로 나뉘는데 의학, 생리학, 공학, 인지심리학 등 여타 학문을 총망라함
• 우리 정부 지난 5월 향후 10년간 3400억원을 투입, 뇌연구의 기반 마련을 위한 '뇌과학 발전전략'을 세움

[오피니언]
• 선웅 고려대교수 우리 스스로 뇌지도 프로젝트 연구를 통해 2020년 이후 가시화될 선진국의 뇌연구 완성 시점을 쫓아가야 한다고 강조
• "미국은 10년간 게놈 프로젝트를 통해 140배의 경제 효과를 냈다"며 (뇌연구 분야에서) 우리도 가만히 있으면 정말 큰일 나겠다는 위기감이 크다고 표현
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헬스통신 16.10.12
[이슈]
대학병원들, 미래 먹거리 사업에 헬스케어 지목
•의료계에 따르면 고려대학교 안암병원, 고신대학교 복음병원 등이 헬스케어 사업에 박차를 가하며 미래 신성장동력으로서의 가능성을 염두에 두고 있다고 발표
• 헬스케어 ICT융합 컨소시엄 지원사업은 헬스케어산업과 정보통신 기술이 융합된 제품과 서비스의 기술개발을 지원하는 사업을 통해 더욱 헤스케어 산업 육성
• 주요 지정과제로 △한국의료기술 제공을 위한 PHR 기반의 원격의료 플랫폼 개발 △스마트 기반 진료의뢰 및 예약연동 진료협력 시스템 및 Web&App. 포털 개발 △생애주기별 질환 관리를 위한 해외수출용 컨텐츠 개발 △만성질환 관리를 위한 융합형 컨텐츠 SW/기기 개발 △글로벌 협진을 위한 클라우드 플랫폼 및 코호트 DB 구축 등 총 5가지로 오는 2017년 5월까지 연구 지원할 계획
• 이번 사업은 단순히 과제를 수행하는데 그치지 않고 고려대학교와 고려대의료원이 추진하는 KU-MAGIC 의료 연구개발의 중요한 과제이기에 연구중심병원으로서 중점 사업으로 추진할 것
• 고신대학교복음병원은 최근 원내 U헬스케어사업단이 아이쿱, 라이프사이언스테크놀로지(이하 LST), 가톨릭의대 U헬스케어사업단과 다자간 업무제휴 협약을 체결하고 본격 가동을 시작했다고 발표
• 의료기기 산업은 연 9%대로 빠르게 성장하고 있으며 특히 웨어러블과 원격진료 의료기기 부품은 연 50% 이상의 성장을 가져올 것으로 전망됨에 따라 부산의 의료산업 발전을 위한 ICT 헬스케어 생태계조성의 필요성에 따라 고신대복음병원은 올해 초 U헬스케어사업단을 출범

[오피니언]
• U헬스케어사업단 조경임 단장은 "헬스케어산업은 기대수명이 100세를 넘어서는 미래세대의 중요한 고부가가치산업"이라며 "이번 협약으로 ICT를 헬스케어산업에 접목한 연구 및 사업 수행으로 성장세인 헬스케어시장의 대표 아이디어로 자리매김하게 될 것으로 기대
• 부산·경남 지역 내에서 장애인 고빈도 이용시설과 의료기관과의 긴밀한 협조 체계 구축으로 디지털헬스케어의 유효성과 안전성을 규명할 수 있는 기반을 마련하는 것과 함께 장애인의 의료접근성과 건강추구권 보장을 위한 의료기술 및 정부정책 발전을 위한 시범사업 진행에 한층 속력이 붙을 전망
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약사공론 16.10.20
[이슈]
신약개발, 국가적 컨트롤타워 통한 거시적 전략 필수
• 김선영 서울대 생명과학부 교수는 20일 오전 7시30분 국회 의원회관에서 열린 대한민국 미래혁신포럼·한반도선진화재단 주최 10월 제3차 정례포럼에서 "국내 신약개발 미래전략은 어떠해야 하는가?" 질문에 대해 답
• "우리나라의 경우 지원이 없는 나라이기 때문에 지식기반 산업을 통해 미래를 준비할 수밖에 없다"면서 "지식기반 산업에서 의약산업은 우리의 먹거리로 주목해야 하는 분야"라고 밝히고 국내 신약개발의 중요성과 그 방향을 설명
• 원천 물질 혹은 기술 특허가 부족이 국내 신약개발의 가장 큰 제한요인으로 꼽았고, 또한 미국의 경우 신약개발 초기단계를 주도하는 그룹들은 START-UP 회사라며 이의 활성화가 부족하다고 진단
• 선진국 수준의 생산 설비 등 하드웨어 및 소프트웨어 부족과 글로벌 성공사례 부족으로 인한 자신감 결여가 문제점으로 지적
• 무엇보다 국가적 차원의 지원이 필요하다고 강조했다. 정부가 컨트롤타워로서의 주도적 역할을 통해 중장기적, 거시적 전략을 세워 신약개발을 추진해야 한다고 제안
• 국가적 차원의 성공에 필요한 요인으로 기업과 정부의 전략과 집행이 거시적 전략과 분야선정과 포트폴리오, 조직 등 구체적 실천 계획이 있어야 한다고 역설
• 코스닥이나 코넥스, VC, 엔젤, M&A 등을 통해 기업의 연구개발 투자 환경을 만들어줘야 한다고 제시
• 전세계 인구의 25%, 한·중·일 GDP 합이 미국의 94%, 송도 및 김포에서 중일 주도 도시가 2시간(1일 생활권)이라는 특성을 살리는 개방 혁신이 필요

[오피니언]
• 정부지원, 투자연계, 중장기계획 수립, 지식기반의 사업에 대한 근본적이고 원론적인 표현은 있었지만 구체적인 대안은 부족했다는 의견

산업/정책 #

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전자신문 2016.10.11
[이슈]
갤럭시노트7 단종…국내 경제 악영향
• 삼성전자가 갤럭시노트7 단종을 결정, 발화 원인을 파악해 재판매를 하더라도 사태 해결이 어렵다는 판단을 한 것으로 풀이
• 홍채인식 등 최신 기술로 화려하게 등장한 갤럭시노트7은 출시 두 달도 안 돼 역사 속으로 사라지는 비운의 스마트폰
• 삼성전자는 문제점을 발견해 수정하고 새로운 제품을 판매하더라도 사태 수습이 불가능하다고 결론
• 오랫동안 신규 부품을 연구개발하고 생산한 업체는 판매선 확보와 재고 처리 우려가 커지고 있고, 홍채인식 기반 금융권 핀테크 확산도 주춤
• 국내 경제에도 먹구름이 드리워짐, 지난해 갤노트5 출시로 9월 반도체 생산이 17.2%, 전체 산업 생산이 54개월 만에 가장 큰 폭(2.4%)의 증가세를 보였으나, 자동차·철도 파업에 악재가 겹치며 청와대 고심이 깊어짐

[오피니언]

• 통인업계 관계자, "소비자 신뢰 회복이 가장 중요하다”면서 “신속한 후속 조치가 이어져야 한다”며 충격의 일단을 내비침
• 삼성전자는 이번 사태를 더 완성도 높은 제품을 만들 수 있는 계기로 삼아야 할 것

생물정보교육 #

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제 34회 KOBIC 차세대 생명정보학 교육
[주제]
R 기초교육 및 유전체 데이터 분석 실습

[일정]
2016년 10월 20일(목) ~ 21일(금)

[장소]
KT인재개발원 1연수관 202호

생물정보 솔루션 및 人Co 워크샵 안내 #

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CLC Main Workbench 구매
[소식]
생.기.다. 프로젝트 - 5. Phylogenetic Tree 완전정복!_CLC Main Workbench 편

[내용]
• 생물정보 분석을 위해 최적의 환경과 지속적 온/오프라인 지원 및 커뮤니케이션 제공을 위한 생물정보 기초 다잡기 프로젝트(생기다) 진행
• 생물의 진화연력을 기반으로 계통 분류를 하 는 Phylogenetic Tree 를 그리는 방법에 대한 포스트 (CLC Main Workbench)
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NEBION, Genevestigator의 인기있는 3개 tool이 무료!
[제목]
2016년 10월 31일까지, GENEVESTIGATOR Professional의 3가지 인기 tool을 무료로 이용

[내용]
• 3가지 tool을 이용하여 관심있는 유전자와 함께 조절되는 유전자들을 찾습니다. 워크플로우는 아래와 같습니다.
• Perturbations tool 관심있는 유전자가 조절되는 특정 조건 검색
• Co-Expression tool 특정 조건에서 유사한 발현 패턴을 갖는 유전자 탐색
• Hierarchical Clustering tool 조직, 세포타입에 따라 동시에 발현되는 유전자들 그룹핑

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(주)인실리코젠

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